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| ［摘要］目的 通过新的虚拟筛选工具PyRx运行AutoDock Vina，对ZINC数据库的2万个化合物进行虚拟筛选，发现新的HIV蛋白酶抑制剂，并且对新的抑制剂与HIV蛋白酶的结合模型进行探索．方法 以HIV蛋白酶为靶点，通过虚拟筛选程序AutoDock Vina对ZINC数据库的化合物进行虚拟筛选．与以前研究不同的是，本研究通过新的虚拟筛选工具PyRx运行AutoDock Vina．HIV蛋白酶晶体结构（PDB ID：4phv）从PDB下载，通过AutoDockTools 对结构进行处理．化合物结构下载自ZINC数据库，通过PyRx导入，处理成pdbqt格式．PyRx运行AutoDock Vina以后，筛选以后的化合物构象导入AutoDockTools进行分析，数据处理用PyMOL完成．结果 从大约2万个化合物库中进行高通量筛选，得到1 000个类药小分子化合物的库．再从这1 000个小分子化合物中筛选针对蛋白酶的抑制剂．通过对建立的化合物数据库进行3轮筛选，发现5个高活性的HIV蛋白酶抑制剂．结论 5个新的抑制剂的进一步开发，将对HIV的治疗和基础研究带来帮助．也对药物虚拟筛选和基于结构的药物开发提供新的信息 |
| 关键词: ［关键词］HIV-1 蛋白酶 抑制剂 虚拟筛选 PyRx |
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